部分宝可梦可通过特殊方式习得隐藏技能，这些技能通常威力强大或具备独特效果。隐藏技能的获取途径包括特定岛屿的教学、剧情道具奖励以及特殊对战奖励。
水系宝可梦的隐藏技能高压水炮需在七之岛的教学点学习，初始选择杰尼龟的玩家可优先解锁。草系宝可梦的硬化植物同样需在七之岛完成教学，妙蛙种子持有者可直接习得。电系宝可梦的闪电可通过招式机25获取，部分高级电系精灵也能自然领悟。岩石系技能岩石封杀需使用招式机39，而毒系泥炸弹仅限特定毒系宝可梦在高级阶段掌握。
超能力系精神干扰和幽灵系影子球分别对应招式机29与30，前者可通过游戏厅兑换获取。钢系钢铁尾巴需使用招式机23，格斗系气合拳则依赖招式机01。飞行系神鸟为火焰鸟专属技能，龙系激鳞仅限高级龙系宝可梦使用。邪恶系啃咬虽普及度较高，但部分宝可梦需通过特定战斗解锁强化版本。
七之岛的隐藏技能与主线剧情紧密关联。红宝石与蓝宝石任务中击败火箭队后获得的密码可解锁仓库中的技能道具。训练师之塔的挑战奖励也可能包含稀有招式机。阿斯卡纳遗迹的图腾宝可梦对战会掉落特殊技能学习器，需通过推动石块的解谜触发。
隐藏技能的实战价值体现在高威力与特效组合上。高压水炮与硬化植物虽需蓄力但伤害可观，精神干扰的附加效果可干扰对手行动。玩家需合理规划技能搭配，避免重复属性覆盖。七之岛的探索顺序也会影响技能获取效率，建议优先完成灯火山与遗迹任务以解锁关键教学点。
最后需注意，部分隐藏技能仅限二周目使用。全国图鉴升级后，七之岛会开放更多教学机会，如暴烈燃烧需小火龙持有者在二周目岛屿学习。技能池的扩展依赖剧情进度，建议玩家在通关后回溯各岛以查漏补缺。
